斜面菌種保藏法是簡便、普遍的保藏方法。具體做法是：將菌種在適宜的斜面培養基上培養成熟后，移入4～6℃的低溫下保藏，以后每隔3～5個月轉管一次。這個方法適用于所有的食用菌菌種，但草菇菌種的貯藏溫度需要提高到10～13℃，不然需在草菇菌落表面灌進3～4毫升10%甘油，起防凍作用。  

    斜面菌種保藏法應注意以下幾點：  

    第一，要選配好合適的培養基，一般要求培養基含有較豐富的有機氮，而盡可能降低糖的含量（一般不宜超過2%），既滿足菌絲生長的需要，又能防止產酸過多，以保持菌種的優良性狀。天然培養基比合成培養基更適用于菌種保藏。保種的培養基好能添加緩沖劑。  

    第二，保藏的菌種要移植在新配制瓊脂斜面上，并在適溫下培養至菌絲在整個斜面基本長滿，入藏的菌種培養時間不可太長，以免降低菌種生活力和保藏時間。  

    第三，保藏期間切勿使棉塞受潮，并定期檢查有無雜菌污染現象，培養基是否失水干縮。  

    第四，菌種的試管口用玻璃紙、塑料薄膜或防潮紙包扎，或用石蠟封閉，以防止培養基內水分過快蒸發。某些菌種（如革菌、多孔菌）試管要用黑色紙包裹后避光保藏，以免在光刺激下菌絲革質化，影響轉管。  

    第五，存放在冰箱內的菌種不可過分擁擠。溫度要控制在4℃左右，不宜過高過低。溫度過低，培養基結冰脫水，菌絲容易衰老死亡；溫度過高，會加快代謝過程，影響保藏期限。  

    第六，保藏菌種在使用前要置于適當溫度下，使其活化，再行轉管擴大培養。專管移植培養基應采用原來的培養基。